1、臨床癥狀不明顯：在性病門診中常可遇到這樣的情況，醫生在給男性患者作出淋病或非淋菌性尿道炎的診斷后，告訴患者要帶配偶或性伴來檢查和治療。患者往往說其配偶或性伴無任何癥狀，不需要檢查。殊不知，由于生理解剖及生殖生理上的差異，女性感染性病后，多呈無癥狀感染或癥狀輕微，患者不易發覺，易成為帶菌者或傳染源。例如男性得了淋病后，癥狀很明顯，往往出現尿痛、尿道口有大量黃色膿性分泌物流出。而女性得了淋病后，一半的病人可不出現任何癥狀，有的表現為白帶增多，顏色發黃，但患者不一定意識到為異常。再如生殖器皰疹，發生在男性外生殖器部位的疼痛性水皰易為患者察覺，而女性可發生在宮頸黏膜，表現為宮頸糜爛、有黏液膿性分泌物，但外陰無皮疹，可無明顯臨床癥狀。
2、診斷較困難：女性得了性病后，臨床癥狀不明顯或缺乏特異性是女性性病診斷較困難的原因之一。例如在女性中不同的性病均可表現為陰道分泌物或白帶增多，臨床上難以鑒別為何種疾病。其次，女性性病的臨床檢查亦較男性困難，男性的外生殖器易暴露，直接檢查即可。而對女性則需借助擴陰器做內檢，才能觀察到陰道和宮頸的病變。發生在陰道或宮頸的尖銳濕疣，如果病變小或部位隱匿，易漏診。此外，實驗室檢查方法在男女兩性中的敏感性和特異性上也有差異。例如分泌物涂片革蘭氏染色檢查，對男性淋病的診斷敏感性和特異性達95%～99%，涂片若查到多形核細胞內有典型形態的革蘭氏陰性雙球菌，即可診斷為淋病。但在女性中，分泌物涂片革蘭氏染色檢查的敏感性僅有50%左右，也就是說用涂片檢查診斷女性淋病，有一半的患者會漏診。因此女性淋病的診斷需要做分泌物細菌培養。
3、出現并發癥的危險性高：女性性病主要發生于性活躍的生育年齡婦女，與性活動和妊娠密切相關，可多種疾病并存。宮頸是易受到多種性傳播疾病病原體侵犯的部位，宮頸的感染若治療不及時或治療不當，病原體可上行感染，引起各種并發癥和后遺癥，如盆腔炎癥性疾病（PID）、不孕癥和異位妊娠。所以對女性性病的治療應及時、正規，用藥要足量。
4、易出現生殖并發癥：婦女在妊娠時若發生性傳播疾病，不僅影響孕婦的健康，也影響胎兒和新生兒的健康。例如懷孕期間得了梅毒，可通過胎盤傳播，導致胎兒流產、死胎或新生兒先天性梅毒。新生兒通過患淋病母親的產道時可感染淋菌性眼炎。患淋病、沙眼衣原體感染、原發性生殖器皰疹和滴蟲感染的孕婦，發生低出生體重兒或早產的比例為10%～35%。因此，對于患性病的孕婦或準備要孩子的婦女應給予必要的咨詢和指導。例如患梅毒的婦女應在正規治療后隨訪2～3年，徹底治愈后方可要孩子。
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