腎小球腎炎是一種自身免疫反應性疾病。具體地說，它可有各種病因（包括病菌、病毒、寄生蟲、藥物等）引起。
這些病原物質作為抗體侵入人體后，體內的防衛機構就產生抵抗這些病原體的物質，稱之為抗體。在抗體對抗抗原的過程中，有兩種情況發生，一種是戰勝侵入人體內的病原體，疾病得以痊愈；另一種是抗體對抗抗原時，同時也破壞自身組織，而引起疾病，這是不正常的免疫反應，稱之為自身免疫反應性疾病。腎小球腎炎的發生，就是通過免疫反應造成腎臟損害。
導致腎小球產生炎癥的機制，主要有3種形式：
（1）免疫復合體腎炎：侵入機體內的致病因素作為抗原促使體內產生抗體。抗原和抗體結合成免疫復合體，循環于血液中，最終沉積在腎小球壁，激活補體系統而引起腎炎。
（2）抗基膜腎炎：機體由于受了外來因素的作用，發生自身免疫反應，產生了抗自己腎小球組織（特別是基膜）的抗體。當這些抗體與腎小球組織（抗原）結合，便發生免疫反應，激活補體系統而引起腎炎。
（3）C3途徑或補體途徑腎炎： 這種腎炎與上述兩種不同之處是它不通過抗原抗體反應激活補體系統，而是致病因素使體內產生了某些能直接激活補體C3的物質，隨后激活其余的補體，并沉積到腎小球中而引起腎炎。
以上3種發病途徑，并不能完滿地解釋現有的腎小球疾病發病過程，腎小球腎炎的發病機制，還有待進一步研究以求完善。
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